MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	CGGAA	2	10	34	43	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014035	G	6	6	49	54	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014035	CGGG	2	8	1492	1499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014035	GCC	2	6	3238	3243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014035	GTT	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014035	CAT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014035	CCGGC	2	10	3376	3385	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014035	GCC	2	6	6930	6935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014035	AACCGG	2	12	6938	6949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014035	GA	3	6	6997	7002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014035	GCC	2	6	7029	7034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014035	GCC	2	6	8117	8122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014035	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014035	GAG	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014035	TGC	2	6	8226	8231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014035	CCG	2	6	8269	8274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014035	TGGG	2	8	8298	8305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014035	GC	3	6	10765	10770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014035	CCG	2	6	10776	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014035	CCGGA	2	10	11601	11610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014035	GAG	2	6	11674	11679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014035	CAC	2	6	11873	11878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014035	CGA	2	6	11957	11962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014035	ATG	2	6	12626	12631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014035	CTG	2	6	14788	14793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014035	CGG	2	6	17259	17264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014035	G	6	6	18093	18098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014035	CGG	2	6	18104	18109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014035	TCA	2	6	19017	19022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014035	GCG	2	6	19051	19056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014035	TGC	2	6	19069	19074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014035	GGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014035	CCA	2	6	21635	21640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014035	CGCC	2	8	21641	21648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014035	CCG	2	6	21661	21666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014035	ATCC	2	8	21686	21693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014035	TCGA	3	12	21700	21711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014035	GC	3	6	21822	21827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014035	CCGCC	2	10	22186	22195	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_014035	CTGAC	2	10	22748	22757	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014035	GGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014035	GAC	2	6	22821	22826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014035	CCG	2	6	26278	26283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014035	CG	3	6	26315	26320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014035	TCGCC	2	10	26554	26563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014035	CG	3	6	26568	26573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014035	GCAG	2	8	26610	26617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014035	GCC	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014035	GAT	2	6	27735	27740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014035	CA	3	6	27793	27798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014035	CTGG	2	8	31959	31966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014035	CCCG	2	8	32020	32027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014035	CGC	2	6	32136	32141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014035	CGC	2	6	32219	32224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014035	GTT	2	6	32273	32278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014035	CTG	2	6	32280	32285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014035	CGG	2	6	32321	32326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014035	CGG	2	6	32342	32347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014035	GAT	2	6	32365	32370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014035	TTG	2	6	36277	36282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014035	GCG	2	6	36297	36302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014035	CCG	2	6	37234	37239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014035	TCG	2	6	37974	37979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014035	GAG	2	6	38025	38030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014035	CGGCG	2	10	38057	38066	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014035	GCGG	2	8	38075	38082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014035	CAG	2	6	38115	38120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014035	GACC	2	8	38183	38190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014035	CG	4	8	38212	38219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014035	GCG	2	6	38239	38244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014035	ACG	2	6	38277	38282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014035	G	6	6	38296	38301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014035	ACG	2	6	38308	38313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014035	GC	3	6	38357	38362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014035	GC	3	6	38376	38381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014035	ACA	2	6	38511	38516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014035	TGG	2	6	38535	38540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014035	TGG	2	6	38553	38558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014035	CCG	2	6	38671	38676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014035	CA	3	6	38722	38727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014035	GCA	2	6	38797	38802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014035	GAAGGT	2	12	38808	38819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014035	CGC	2	6	39866	39871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014035	GCC	2	6	39920	39925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014035	CGC	2	6	39943	39948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014035	GCC	2	6	45487	45492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014035	AAAT	2	8	45510	45517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014035	TCC	2	6	46569	46574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014035	GGTC	2	8	46610	46617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014035	CGC	2	6	46698	46703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014035	CCT	2	6	46739	46744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014035	GCC	2	6	46860	46865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014035	CGC	2	6	46875	46880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014035	CCG	2	6	46892	46897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014035	TC	3	6	46898	46903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014035	ATC	2	6	46955	46960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014035	TGCT	2	8	46980	46987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014035	GGA	2	6	47017	47022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014035	ACCG	2	8	48055	48062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014035	CCG	2	6	48078	48083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014035	GGCC	2	8	50218	50225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014035	CT	3	6	50248	50253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014035	TGC	2	6	50254	50259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014035	CCG	2	6	50289	50294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014035	GGC	2	6	50347	50352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014035	TGGC	2	8	50365	50372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014035	GGA	2	6	50417	50422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014035	GCG	2	6	50489	50494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014035	GCC	2	6	51279	51284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014035	TGA	2	6	52628	52633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014035	AAGG	2	8	52639	52646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014035	GCG	2	6	52654	52659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014035	CGC	2	6	52963	52968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_014035	GGC	2	6	52982	52987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014035	TC	3	6	54845	54850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014035	CGC	2	6	54861	54866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014035	TC	3	6	63919	63924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014035	AGG	2	6	63929	63934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014035	TCC	2	6	64569	64574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014035	CCG	2	6	64601	64606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014035	GCA	2	6	64637	64642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014035	GCC	2	6	64651	64656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014035	ACC	2	6	64659	64664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014035	GCC	2	6	64693	64698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014035	GCG	2	6	64707	64712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014035	TCG	2	6	64730	64735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014035	CATGC	2	10	68148	68157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014035	C	6	6	71302	71307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_014035	GC	3	6	72058	72063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014035	GCC	2	6	72527	72532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014035	TC	3	6	72535	72540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014035	GTG	2	6	73171	73176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014035	TGACC	2	10	73190	73199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014035	CGCC	2	8	73200	73207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_014035	GATC	2	8	73224	73231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014035	GGC	2	6	73236	73241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014035	CGAC	2	8	73331	73338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014035	TCG	2	6	73366	73371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014035	CGGG	2	8	73381	73388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014035	GACG	2	8	73436	73443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014035	AGCT	2	8	73457	73464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014035	ATG	2	6	73475	73480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014035	AAAG	2	8	73508	73515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014035	GTT	2	6	73525	73530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014035	GTG	2	6	73558	73563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014035	CAA	2	6	77213	77218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014035	GCG	2	6	77274	77279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014035	TCG	2	6	77327	77332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014035	CGGG	2	8	77342	77349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014035	TGCA	2	8	77427	77434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014035	TCA	2	6	77496	77501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014035	AAT	2	6	77598	77603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014035	CT	3	6	77627	77632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014035	GCT	2	6	77663	77668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014035	GGGC	2	8	79946	79953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_014035	CGC	2	6	79972	79977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_014035	ATC	2	6	80030	80035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014035	GTG	2	6	81603	81608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014035	TCG	2	6	81621	81626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014035	GCGTC	2	10	82950	82959	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_014035	TCG	2	6	83089	83094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_014035	CGC	2	6	83243	83248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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170	NC_014035	CCG	2	6	83385	83390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_014035	CGC	2	6	83433	83438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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176	NC_014035	CGC	2	6	83826	83831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_014035	CG	3	6	87340	87345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014035	GCC	2	6	87350	87355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_014035	TTG	2	6	87375	87380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014035	GGA	2	6	87396	87401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014035	TGC	2	6	87460	87465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_014035	TGC	2	6	122566	122571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_014035	CGC	2	6	125122	125127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_014035	C	6	6	130078	130083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
276	NC_014035	TG	3	6	130090	130095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014035	CAG	2	6	130126	130131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_014035	GCG	2	6	130175	130180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_014035	TTC	2	6	130189	130194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_014035	GC	3	6	130238	130243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
281	NC_014035	GCG	2	6	130252	130257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_014035	CCGG	2	8	130295	130302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_014035	GGA	2	6	131405	131410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014035	GCG	2	6	131422	131427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.